Ve ztrátě se nachází i Lufthansa Cargo. Společnost za prvních 9 měsíců roku 2015 vykázala ztrátu 38 milionů EUR. Německému nákladnímu dopravci pokleslo vytížení letadel z 67,1 % na 62,4%. Podíl nákladní divize na celkovém obratu Lufthansy rovněž poklesl na 8,3 %. Jako součást ozdravného plánu budou bez náhrady do konce listopadu vyřazeny dva letouny McDonnell Douglas MD-11F. Lufthansa Cargo v současné době provozuje 14 letadel McDonnell Douglas MD-11F a 5 Boeingů 777F.  Lufthansa Cargo v současné době létá do 55 destinací, všechny lety operované letadly mateřské společnosti operují z Frankfurtu.  Nákladní letouny Lufthansa Cargo se v současné době pravidelně objevují v Aguadille , Almaty, Aschabadu, Aguadille,  Atlantě, Bangkoku, Bangalore, Bogotě, Buenos Aires, Chennai, Chicagu,  Curitibě, Dhace, Dillí, Dallasu, Dakaru, Dammámu, Dohá, Guangzhou, Hong Kongu, Hyderabadu, Houstonu, Istanbulu, Jakartě, Johannesburgu, Káhiře, Krasnoyarsku, Los Angeles, Madridu, Manchesteru, Mexico City, Miláně,  Montevideu, Moskvě,  Mumbaji, Nairobi, Natalu, New Yorku, Pekingu, Quitu, Rijádu,  Seoulu, Šanghaji, Saigonu,  Santiagu, Sao Paulu, Shannonu,  Seville, Sharjah, Singapuru, Stavangeru, Taškentu, Tokyu, Tel Avivu a  Toronta.